母液从蒸发器的顶部进入分子蒸馏装置，经转子上的料液分布器被连续均匀地分布到垂直的筒体加热面上，在刮膜器的作用下，强制形成一层极薄的湍流状液膜，以螺旋状向下流动。轻分子几乎未经碰撞就从加热面逸出，经很短的距离到内置的冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通过位于蒸发器底部的出料管排出；重分子沿筒体加热面往下流，在加热区下的集液槽中汇聚并从侧面的出口流出。